Aunque la directiva se ha etiquetado como una de las que se maneja lejos de los escándalos, y se vanagloria de tratar bien al futbolista, la realidad es que su larga historia no ha estado exenta de malos momentos, no sólo en lo deportivo, sino también en lo gerencial, siendo la época de Guillermo Álvarez Cuevas como presidente del club, la más criticada.
Ligas oscuras con promotores, rescisión de contrato a todo el plantel, pérdida de puntos por alineación indebida, y ahora lo que parecen golpes de estado en la presidencia, en el Cruz Azul pasa de todo, lo que explica de una forma u otra, el por qué el club tiene ya casi 22 años sin conseguir un campeonato de Liga.